阎应元的领导下，江阴以区区一座小县城，抵抗数万清军长达八十天有余。先败清常州知府宗灏，再败明降将刘良佐，三败清恭顺王孔有德，其经典之语“有降将军，无降典史！”说的明朝各个降将羞愧难当。后由于缺乏外援，才清贝勒博洛和贝勒尼堪带领满洲兵携红衣大炮的情况下，城破被俘，不屈而死。
阎应元领导下的江阴士民，同心同德，城破以后，依然拚死巷战，“竟无一人降者”。加上清军攻占后连续三天的屠城，城内数万百姓仅剩“大小五十三人”而已。当时人士写了一副对联赞扬阎应元及江阴百姓的英勇牺牲精神：“八十日戴发效忠，表太祖十七朝人物；六万人同心死义，存大明三百里江山。”
江阴战役虽然不像一些野史所记清朝“七王”、“翼王”、“十王”都阵亡于城下，但参加攻城的确有后来晋封的端重亲王博洛、敬谨亲王尼堪、恭顺王孔有德。
江南各地对清兵望风披靡之时，阎应元、陈明遇以微末下吏凭借江阴百姓的支持，竟然面对强敌，临危不惧，坚持了近三个月，实是南明史上光彩夺目的一页。
《江阴城守后纪》的作者总结道：“有明之季，士林无羞恶之心。居高官、享重名者，以蒙面乞降为得意；而封疆大帅，无不反戈内向。独陈、阎二典史乃于一城见义。向使守京口如是，则江南不至拱手献人矣。”
的确可以做出这样的类比，阎应元扼守一座小小县城尚能力挺两个多月，如果让他布防南京，怎么可能那么快地出现城破国亡之事？！
虽然王燃不了解这段历史，但现并不重要，因为王燃已经决定将这个特种大队大队长的职位交给阎应元。应该说，这相较于原来的时空，阎应元的军事才能已经有机会得到早的体现。
“阎大哥，你正式接手这个特种大队之前，我必须声明，这个大队长目前只能是从八品之职…而且只要我还是从七品，这个从八品就提不上去…”王燃不了解阎应元典史的级别，很不好意思地解释道。
“什么，从八品？那我岂不是可以连跳三级了？”本来还一付淡泊明志状的阎应元眼睛一亮，显见中国“官本位”的思想早已根深蒂固。这也难怪，其实只要是想有一番作为的人，没有一个官职身，是没有机会实现自己的理想的…
连跳三级？王燃心里粗略一算，这个典史岂不是和“弼马温”一样，是个不入流的官？王燃决定不提此事，免得有碍阎应元的面子：“阎大哥，你官上任，准备怎么干呢？”
“兄弟，不，钦差大人…”阎应元王燃有些诧异的目光中正容说道：“既然我现正式成了你的手下，这‘兄弟’二字人前就不要再提了…”然后话锋一转说道：“依我看，一支兵队伍，重要的就是训练，因此相应的装备必须快落实，这样训练才能有针对性…”
“你说的不错，我也琢磨这件事…”王燃皱了皱眉头：“我没想到这次招到了这么多人，我的报告上只要了两百人的装备…”
阎应元一笑：“这件事对别人来说也许很难，但对你来说就太容易了…”